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qPCR實驗結果分析基本步驟(一)
發(fā)布時間: 2021-10-15 點擊次數: 10834次實時熒光定量PCR實驗會產生大量實驗數據,一般可以用PCR儀自帶的軟件進行收集、分析。但即使有了方便可靠的軟件,我們也需要對原始數據進行檢查、再分析,評估數據的質量和可靠性。
這需要三個基本的步驟。
第一步,查看擴增曲線,有必要時調整基線和閾值。
Ct值由基線和閾值計算得來,所以他們的值對結果影響很大。軟件會給出1個默認的基線和閾值,但不一定是最合適的,需要我們進行手動調整。
首*行基線的調整。
一般范圍是循環(huán)數3~15,使得靶基因的擴增信號大于背景噪聲。出現不正常的擴增曲線,通常是因為設置了不正常的基線,需要對單個孔進行設置。
比較好的做法是,基線的最小值(起始循環(huán)數)設置在背景噪聲的尾巴后,最大值(結束循環(huán)數)設置為擴增起始點。
循環(huán)范圍在5個循環(huán)就可以,具體跟擴增曲線的對數圖來設定。
擴增曲線的對數圖是什么?下期告訴你
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